Hunewald、Grant、Boehm等发表预印本研究,提出一种无需门控层级、人工设定标志物阈值或任务专用训练数据的流程:将质谱流式聚类(如FlowSOM、GigaSOM)的中位标志物强度按标志物缩放并归并为数十个元簇,再把连续标志物谱一次性交给大语言模型,由其返回细胞类型标签与置信度。论文称,在覆盖血液、骨髓和肠道的四个人与小鼠数据集中,单一选定的模型在主要谱系层面与参考注释的元簇一致率为85-98%(Claude Sonnet 4.6为85-98%,最佳本地模型为83-96%),校正偶然一致性后Cohen's k为0.67-0.83。作者称本地开源权重模型在独立基准上与云端模型相当,但可靠性因模型而异,Claude Opus 5并不比Sonnet 4.6更可靠。两名专家对同一热图盲法标注,主要谱系一致率约99%,T细胞成熟状态仅约73%,最佳模型落在专家分歧范围内。
研究称语言模型可自动标注质谱流式细胞簇,一致性达85-98%
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