bioRxiv：EMBER基因基础模型可预测单基因与组合扰动效应

据bioRxiv预印本，Ho、Xing与Ma提出基因中心基础模型EMBER，通过交互引导的对比学习与掩码表达重建，在按细胞类型与实验批次平衡采样的单细胞语料上预训练，学习依赖上下文的功能性基因表征。该模型将基因表征学习与任务预测解耦：预训练编码器保持冻结，由轻量探针组合上下文基因嵌入，预测单基因扰动响应、双基因相互作用及多靶点药物响应。作者称，相较所评估的基线，EMBER在跨情境扰动响应预测与遗传互作排序上有所提升，并在mTOR抑制条件下将自噬体-溶酶体融合介导因子SCFD1列为候选依赖性。上述结果来自未经同行评审的预印本。